MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/971

Total Repeats: 20294

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021899	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527328295
2	NC_021899	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527328295
3	NC_021899	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527328295
4	NC_021899	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328295
5	NC_021899	T	6	6	1384	1389	0 %	100 %	0 %	0 %	527328295
6	NC_021899	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328295
7	NC_021899	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328295
8	NC_021899	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527328295
9	NC_021899	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328295
10	NC_021899	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	527328295
11	NC_021899	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527328295
12	NC_021899	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328295
13	NC_021899	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328296
14	NC_021899	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527328296
15	NC_021899	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328296
16	NC_021899	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	527328296
17	NC_021899	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	527328296
18	NC_021899	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527328296
19	NC_021899	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328296
20	NC_021899	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328296
21	NC_021899	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527328296
22	NC_021899	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	527328297
23	NC_021899	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527328297
24	NC_021899	TC	3	6	2234	2239	0 %	50 %	0 %	50 %	527328297
25	NC_021899	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527328297
26	NC_021899	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527328297
27	NC_021899	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527328297
28	NC_021899	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527328297
29	NC_021899	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328297
30	NC_021899	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328297
31	NC_021899	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527328297
32	NC_021899	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328297
33	NC_021899	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527328297
34	NC_021899	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527328297
35	NC_021899	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	527328297
36	NC_021899	T	6	6	2828	2833	0 %	100 %	0 %	0 %	527328297
37	NC_021899	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328297
38	NC_021899	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527328297
39	NC_021899	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527328297
40	NC_021899	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	527328297
41	NC_021899	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328297
42	NC_021899	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328297
43	NC_021899	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328297
44	NC_021899	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328297
45	NC_021899	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	527328297
46	NC_021899	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	527328297
47	NC_021899	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328297
48	NC_021899	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328297
49	NC_021899	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527328297
50	NC_021899	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527328297
51	NC_021899	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	527328298
52	NC_021899	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527328298
53	NC_021899	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527328298
54	NC_021899	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	527328298
55	NC_021899	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527328298
56	NC_021899	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	527328298
57	NC_021899	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328298
58	NC_021899	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	527328298
59	NC_021899	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328298
60	NC_021899	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328298
61	NC_021899	A	7	7	4328	4334	100 %	0 %	0 %	0 %	527328298
62	NC_021899	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527328298
63	NC_021899	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	527328298
64	NC_021899	A	7	7	4374	4380	100 %	0 %	0 %	0 %	527328298
65	NC_021899	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527328298
66	NC_021899	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	527328298
67	NC_021899	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	527328298
68	NC_021899	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527328298
69	NC_021899	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328298
70	NC_021899	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328298
71	NC_021899	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328298
72	NC_021899	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527328298
73	NC_021899	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	527328298
74	NC_021899	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527328298
75	NC_021899	AAAGCT	2	12	4941	4952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527328298
76	NC_021899	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	527328298
77	NC_021899	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527328298
78	NC_021899	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328298
79	NC_021899	ATT	2	6	5149	5154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527328299
80	NC_021899	TCT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328299
81	NC_021899	GCT	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328299
82	NC_021899	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	527328299
83	NC_021899	GAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527328299
84	NC_021899	TC	3	6	5264	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	527328299
85	NC_021899	GA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	50 %	0 %	527328299
86	NC_021899	ACG	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328299
87	NC_021899	GAA	2	6	5310	5315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328299
88	NC_021899	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	527328299
89	NC_021899	AT	3	6	5379	5384	50 %	50 %	0 %	0 %	527328299
90	NC_021899	AGA	3	9	5387	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328299
91	NC_021899	GCT	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328299
92	NC_021899	AGA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328299
93	NC_021899	TGG	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527328299
94	NC_021899	AGA	3	9	5459	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328299
95	NC_021899	GGA	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527328299
96	NC_021899	TG	3	6	5532	5537	0 %	50 %	50 %	0 %	527328299
97	NC_021899	TA	3	6	5603	5608	50 %	50 %	0 %	0 %	527328299
98	NC_021899	T	6	6	5610	5615	0 %	100 %	0 %	0 %	527328299
99	NC_021899	TCA	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527328299
100	NC_021899	GGA	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527328299
101	NC_021899	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	527328299
102	NC_021899	CTT	2	6	5750	5755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328299
103	NC_021899	CTG	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328299
104	NC_021899	CAG	2	6	5911	5916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328299
105	NC_021899	AG	3	6	5940	5945	50 %	0 %	50 %	0 %	527328299
106	NC_021899	GGGA	2	8	6215	6222	25 %	0 %	75 %	0 %	527328299
107	NC_021899	AGG	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527328300
108	NC_021899	GAA	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328300
109	NC_021899	GGTG	2	8	6518	6525	0 %	25 %	75 %	0 %	527328300
110	NC_021899	AAAT	2	8	6584	6591	75 %	25 %	0 %	0 %	527328300
111	NC_021899	GCA	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328300
112	NC_021899	AAG	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328300
113	NC_021899	TGC	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328300
114	NC_021899	ATTT	2	8	7096	7103	25 %	75 %	0 %	0 %	527328301
115	NC_021899	TTA	2	6	7154	7159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527328301
116	NC_021899	TTTG	2	8	7188	7195	0 %	75 %	25 %	0 %	527328301
117	NC_021899	GAA	2	6	7203	7208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328301
118	NC_021899	TCG	2	6	7316	7321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328302
119	NC_021899	TCC	2	6	7359	7364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527328302
120	NC_021899	GTT	2	6	7467	7472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527328302
121	NC_021899	AC	3	6	7649	7654	50 %	0 %	0 %	50 %	527328302
122	NC_021899	T	6	6	7685	7690	0 %	100 %	0 %	0 %	527328302
123	NC_021899	TGGTA	2	10	7692	7701	20 %	40 %	40 %	0 %	527328302
124	NC_021899	AAGC	2	8	7822	7829	50 %	0 %	25 %	25 %	527328302
125	NC_021899	TTA	2	6	7837	7842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527328302
126	NC_021899	A	6	6	7969	7974	100 %	0 %	0 %	0 %	527328302
127	NC_021899	T	6	6	8054	8059	0 %	100 %	0 %	0 %	527328302
128	NC_021899	TTC	2	6	8160	8165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328302
129	NC_021899	ATTG	2	8	8220	8227	25 %	50 %	25 %	0 %	527328303
130	NC_021899	GAA	2	6	8304	8309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328303
131	NC_021899	AG	3	6	8392	8397	50 %	0 %	50 %	0 %	527328303
132	NC_021899	ACC	2	6	8432	8437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527328303
133	NC_021899	CTT	2	6	8485	8490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328303
134	NC_021899	CT	4	8	8511	8518	0 %	50 %	0 %	50 %	527328303
135	NC_021899	GAG	2	6	8565	8570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527328303
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